Dưới thời Việt Nam Cộng hòa, Ninh Hiệp là một xã thuộc quận Ninh Hòa và là nơi đặt quận lỵ quận Ninh Hòa. Xã Ninh Hiệp khi đó gồm 2 thôn Mỹ Hiệp và Vĩnh Phú.[4]

Sau năm 1975, Chính quyền sáp nhập quận Ninh Hòa và quận Vạn Ninh thành huyện Khánh Ninh, xã Ninh Hiệp thuộc huyện Khánh Ninh.

Ngày 23 tháng 10 năm 1978, Hội đồng Chính phủ ban hành Quyết định 268-CP[1]. Theo đó, thành lập thị trấn Ninh Hòa trên cơ sở toàn bộ diện tích, dân số của xã Ninh Hiệp và một phần diện tích, dân số của các xã Ninh Bình, Ninh Đa, Ninh Đông, Ninh Giang, Ninh Quang.

Ngày 5 tháng 3 năm 1979, huyện Khánh Ninh được chia thành hai huyện Ninh Hòa và Vạn Ninh[5], thị trấn Ninh Hòa trở thành huyện lỵ huyện Ninh Hòa.

Ngày 30 tháng 6 năm 2009, Bộ Xây dựng ban hành Quyết định 713/QĐ-BXD về việc công nhận thị trấn Ninh Hòa là đô thị loại IV.[6]

Ngày 25 tháng 10 năm 2010, Chính phủ ban hành Nghị quyết 41/NQ-CP[2]. Theo đó, chuyển huyện Ninh Hòa thành thị xã Ninh Hòa và thành lập phường Ninh Hiệp trên cơ sở toàn bộ 588 ha diện tích tự nhiên, 21.838 người của thị trấn Ninh Hòa.